179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0232 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0232  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 425 aa  862    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3299  extracellular solute-binding protein  61.17 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7039  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3847  extracellular solute-binding protein family 1  49.13 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00585532  normal  0.205792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  42.89 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  40.09 
 
 		 418 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  35.49 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3428  extracellular solute-binding protein  36.27 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  31.46 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.06 
 
 		 439 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.02 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 455 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.45 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.69 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.03 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0354  ABC transporter substrate binding protein (sn-glycerol 3-phosphate)  29.47 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.36 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.01 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  30.43 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.37 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.61 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1185  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1092  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.33 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1155  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  26.94 
 
 		 434 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 457 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 424 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  28.87 
 
 		 431 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 446 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2014  sn-glycerol-3-phosphate-binding periplasmic protein ugpB precursor  28.72 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167012  hitchhiker  0.0071297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1264  glycerol-3-phosphate-binding periplasmic lipoprotein signal peptide  25.07 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.400828  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2055  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.822621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1881  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000340671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  27.66 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4134  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  28.74 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.25 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.23 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5667  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06396  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  29.07 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04930  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.07 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 458 aa  49.7  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.25 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2738  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.345118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3650  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.144474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2173  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00822083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  21.12 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>