255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5667 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5667  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 410 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3451  extracellular solute-binding protein  57.77 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.772574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.99 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.34 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.57 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0322  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  23.44 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  23.44 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  23.19 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.46 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  22.91 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  22.96 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  22.66 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.61 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  22.91 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  22.66 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.65 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.75 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.75 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.44 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.23 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.43 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.99 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  23.69 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.39 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 437 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  20.91 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.52 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3612  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.423524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  28.4 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3624  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 425 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 425 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 445 aa  53.1  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>