299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3422 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  93.58 
 
 		 187 aa  309  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  80.11 
 
 		 185 aa  270  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  64.86 
 
 		 186 aa  240  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  62.43 
 
 		 181 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  62.22 
 
 		 186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  62.98 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  65.76 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  62.94 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 191 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 180 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  27.33 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  23.03 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6374  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 233 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  51.92 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  29.17 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 346 aa  47.8  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  29.79 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  45 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 391 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>