More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0994 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  100 
 
 		 387 aa  792    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  75.39 
 
 		 386 aa  620  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  74.61 
 
 		 386 aa  614  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  74.87 
 
 		 386 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  72.7 
 
 		 386 aa  597  1e-169  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  49.46 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  48.95 
 
 		 514 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  48.39 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  49.87 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  47.73 
 
 		 514 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  47.92 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  47.95 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.54 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  46.41 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  46.76 
 
 		 492 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  47.04 
 
 		 492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  44.41 
 
 		 500 aa  318  1e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  46.63 
 
 		 492 aa  315  8e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  46.37 
 
 		 492 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.85 
 
 		 505 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  46.74 
 
 		 485 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  47.65 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  45.18 
 
 		 504 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  46.2 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  46.56 
 
 		 378 aa  305  6e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  43.42 
 
 		 502 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  45.1 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  45.24 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  45.86 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  43.48 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1624  pyruvate carboxyltransferase  43.94 
 
 		 388 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  42.74 
 
 		 503 aa  295  7e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.92 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  44.29 
 
 		 483 aa  288  9e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  44.48 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  42.55 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  43.75 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2339  trans-homoaconitate synthase  40.57 
 
 		 377 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  41.88 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  41.14 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  44 
 
 		 507 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  41.57 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  42.61 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  43.24 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0633  trans-homoaconitate synthase  43.48 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0200993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0375  trans-homoaconitate synthase  42.2 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  41.62 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  43.25 
 
 		 504 aa  279  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  41.89 
 
 		 522 aa  277  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  41.31 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  43.78 
 
 		 503 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  42.58 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3330  2-isopropylmalate synthase  40.36 
 
 		 524 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.91 
 
 		 347 aa  272  7e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2110  trans-homoaconitate synthase  40.11 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  42.63 
 
 		 509 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 490 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  40.74 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  41.25 
 
 		 527 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1938  trans-homoaconitate synthase  39.54 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00360416  unclonable  0.0000000147263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2112  2-isopropylmalate synthase  40.1 
 
 		 524 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.92 
 
 		 496 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  41.69 
 
 		 515 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  41.54 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1808  2-isopropylmalate synthase  41.11 
 
 		 475 aa  265  8e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.787559  hitchhiker  0.000060507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2146  trans-homoaconitate synthase  37.54 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  40.48 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2073  trans-homoaconitate synthase  37.25 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  40.74 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  39.71 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  36.63 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1171  2-isopropylmalate synthase  42.03 
 
 		 520 aa  264  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0051552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  43.77 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 521 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2715  2-isopropylmalate synthase  40.37 
 
 		 520 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  44.19 
 
 		 509 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  42.77 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  38.56 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  41.76 
 
 		 510 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  38.95 
 
 		 532 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  41.69 
 
 		 519 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  40.59 
 
 		 514 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  38.24 
 
 		 526 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  43.82 
 
 		 510 aa  258  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2059  2-isopropylmalate synthase  38.24 
 
 		 489 aa  258  9e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0773223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  38.95 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  38.95 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  40.11 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3466  trans-homoaconitate synthase  37.91 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  39.84 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  41.13 
 
 		 515 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  42.31 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  43.66 
 
 		 507 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  36.07 
 
 		 508 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  39.57 
 
 		 520 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29150  predicted protein  42.35 
 
 		 624 aa  255  9e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  39.31 
 
 		 525 aa  255  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0937  trans-homoaconitate synthase  37.68 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>