More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1683 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  100 
 
 		 853 aa  1731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  34.25 
 
 		 754 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  39.38 
 
 		 637 aa  350  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  40.61 
 
 		 649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 		 642 aa  319  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  39.43 
 
 		 642 aa  317  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  35.8 
 
 		 637 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  33.07 
 
 		 684 aa  280  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  55.51 
 
 		 1100 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 410 aa  265  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  35.31 
 
 		 536 aa  253  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  41.05 
 
 		 366 aa  247  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  50.2 
 
 		 1082 aa  247  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  51.15 
 
 		 1087 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  50.61 
 
 		 1079 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  50.77 
 
 		 1087 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  42.81 
 
 		 1083 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 		 775 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 1741 aa  210  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.86 
 
 		 396 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.44 
 
 		 862 aa  195  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  38.06 
 
 		 823 aa  172  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.27 
 
 		 905 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 3706 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 526 aa  162  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  37.64 
 
 		 706 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 904 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1716  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.63 
 
 		 1238 aa  160  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  40.31 
 
 		 708 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.3 
 
 		 630 aa  157  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1820 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 524 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 527 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1313 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.6 
 
 		 1134 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  36.74 
 
 		 548 aa  152  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.25 
 
 		 673 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.07 
 
 		 501 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 1138 aa  150  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 1079 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  40.31 
 
 		 365 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0029  hypothetical protein  25.4 
 
 		 976 aa  148  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0030  hypothetical protein  26.08 
 
 		 976 aa  148  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 737 aa  148  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 500 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 685 aa  146  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 1390 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.11 
 
 		 632 aa  145  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 499 aa  144  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  33.33 
 
 		 462 aa  144  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.09 
 
 		 929 aa  144  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.968718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 		 376 aa  144  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  37.8 
 
 		 469 aa  144  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 		 477 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 398 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 1167 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.92 
 
 		 467 aa  143  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1287 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.96 
 
 		 917 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.72 
 
 		 1078 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 884 aa  142  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  33 
 
 		 463 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.46 
 
 		 423 aa  142  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 		 361 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.79 
 
 		 563 aa  141  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1007 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  52.31 
 
 		 511 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  35.48 
 
 		 470 aa  140  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.69 
 
 		 678 aa  140  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  37.8 
 
 		 455 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.2 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.07 
 
 		 1036 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3530  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.1 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 		 494 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.32 
 
 		 1017 aa  138  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  24.82 
 
 		 817 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.58 
 
 		 447 aa  138  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  24.82 
 
 		 817 aa  138  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1680 aa  138  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  32.87 
 
 		 502 aa  137  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03712  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1178 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433519  normal  0.713314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 769 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  32.25 
 
 		 474 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.82 
 
 		 1207 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  35.84 
 
 		 465 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  35.62 
 
 		 705 aa  135  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  32.84 
 
 		 447 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.54 
 
 		 631 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 379 aa  135  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 743 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.4 
 
 		 457 aa  135  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 		 967 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 		 967 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 775 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.78 
 
 		 508 aa  135  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  24.81 
 
 		 509 aa  135  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  32.41 
 
 		 364 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>