More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00670 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4760  DEAD/H associated domain protein  45.73 
 
 		 846 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0821998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0372  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.04 
 
 		 847 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0453  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 		 851 aa  778    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.293341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0826  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.12 
 
 		 851 aa  812    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00406242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2792  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.5 
 
 		 801 aa  742    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.536438 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1188  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.39 
 
 		 930 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.558323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3478  DEAD/H associated domain protein  46.68 
 
 		 836 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0187  DEAD/DEAH box helicase  46.76 
 
 		 835 aa  737    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0864531  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0658  ATP-dependent helicase  43.84 
 
 		 799 aa  690    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3154  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.68 
 
 		 836 aa  755    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4613  DEAD/DEAH box helicase  45.25 
 
 		 937 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  44.56 
 
 		 804 aa  743    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.55 
 
 		 824 aa  747    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0986  DEAD/DEAH box helicase-like  42.11 
 
 		 807 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0747  DEAD/DEAH box helicase-like  47.23 
 
 		 905 aa  772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4042  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.53 
 
 		 851 aa  799    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0266377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0615  large atp-dependant helicase-related protein  46.61 
 
 		 835 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0797  DEAD/DEAH box helicase-like  45.62 
 
 		 904 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79097  normal  0.907891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0240  DEAD/DEAH box helicase-like  47.45 
 
 		 853 aa  767    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.72 
 
 		 884 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.95 
 
 		 806 aa  735    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0029  DEAD/H associated  47.07 
 
 		 839 aa  776    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0530  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.59 
 
 		 849 aa  811    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.449477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0802  putative ATP dependent DNA helicase  48.62 
 
 		 951 aa  797    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0602568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.13 
 
 		 809 aa  769    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.347748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0875  DEAD/H associated domain protein  46.87 
 
 		 908 aa  778    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.888716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3350  DEAD/H associated domain protein  46.33 
 
 		 834 aa  761    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0413  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.82 
 
 		 811 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1119  DEAD/H associated domain protein  43.46 
 
 		 807 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.913802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0263  DEAD/H associated domain protein  47.39 
 
 		 890 aa  749    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  47.54 
 
 		 841 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00670  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  100 
 
 		 868 aa  1791    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0574  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.36 
 
 		 799 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  47.82 
 
 		 853 aa  792    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.43 
 
 		 846 aa  751    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.593625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2311  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.96 
 
 		 799 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.266127  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.89 
 
 		 851 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0778  putative DEAD/DEAH box helicase  33.57 
 
 		 882 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4460  DEAD/H associated domain protein  34.32 
 
 		 881 aa  426  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3000  DEAD/H associated domain protein  33.37 
 
 		 869 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01735  ATP-dependent helicase  33.89 
 
 		 833 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3880  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.81 
 
 		 830 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1853  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.58 
 
 		 898 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1103  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.66 
 
 		 816 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.16 
 
 		 844 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1024  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.55 
 
 		 833 aa  409  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1205  DEAD/DEAH box helicase-like  32.3 
 
 		 829 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02265  Helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.65 
 
 		 820 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.269973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1143  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.1 
 
 		 816 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329309  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3525  ATP-dependent helicase  30.41 
 
 		 813 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4858  DEAD/H associated domain protein  32.98 
 
 		 952 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4141  helicase domain protein  33.49 
 
 		 836 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 817 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6864  DEAD/H associated domain protein  31.29 
 
 		 820 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6751  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 		 888 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1756  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.25 
 
 		 819 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.07 
 
 		 816 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.638833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3332  DEAD/H associated domain protein  29.64 
 
 		 823 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  29.74 
 
 		 831 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2194  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.25 
 
 		 870 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.254587  decreased coverage  0.00486766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1517  helicase  31.51 
 
 		 825 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.114808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1039  DEAD/DEAH box helicase-like  29.36 
 
 		 824 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171221  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  30.95 
 
 		 828 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 828 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.41 
 
 		 828 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3045  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.78 
 
 		 966 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279323  normal  0.639762 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 825 aa  361  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.313414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2961  DEAD/H associated domain protein  30.64 
 
 		 819 aa  359  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0376  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 1014 aa  351  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0312  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 970 aa  341  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2563  DEAD/H associated domain protein  29.64 
 
 		 840 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0307  DEAD/H associated domain protein  30.51 
 
 		 970 aa  337  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 900 aa  329  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  28 
 
 		 888 aa  299  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  27.52 
 
 		 1688 aa  270  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.87 
 
 		 1412 aa  265  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 		 1508 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 		 1505 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  25.99 
 
 		 875 aa  252  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  25.46 
 
 		 873 aa  252  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 		 1497 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  27.59 
 
 		 922 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  31.14 
 
 		 1515 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 		 1518 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.8 
 
 		 1480 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  29.7 
 
 		 1448 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  29.36 
 
 		 1448 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  27.67 
 
 		 1504 aa  244  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.01 
 
 		 1626 aa  241  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  25.75 
 
 		 941 aa  241  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  28.18 
 
 		 1573 aa  241  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  27.46 
 
 		 915 aa  240  9e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.05 
 
 		 970 aa  239  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.78 
 
 		 1429 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 1475 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.29 
 
 		 1700 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  32.13 
 
 		 1598 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  27.11 
 
 		 874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  27.01 
 
 		 874 aa  235  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.46 
 
 		 1426 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>