More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5211 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
445 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.83 
 
 
445 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 
449 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.16 
 
 
691 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
691 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
563 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1177  chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
469 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.5025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 
656 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
667 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
688 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
567 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.08 
 
 
563 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
564 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 
681 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0120  chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
445 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.118781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 
563 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
686 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
561 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 
563 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
688 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
688 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
566 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
656 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3241  chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 
445 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
670 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 
673 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 
563 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.89 
 
 
712 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
560 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
602 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
561 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
566 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  41.19 
 
 
561 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
573 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 
447 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
507 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0262  chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 
442 aa  193  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  44.95 
 
 
565 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 
562 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  39.3 
 
 
563 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
565 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
688 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
577 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
711 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 
561 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
689 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
731 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.96 
 
 
716 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 
561 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
563 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.44 
 
 
505 aa  189  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0566767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
428 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
681 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 
562 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.56 
 
 
674 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.12 
 
 
568 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 
561 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 
656 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
674 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
566 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
563 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
689 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
675 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
563 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 
672 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  45.02 
 
 
714 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
563 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.22 
 
 
567 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.45 
 
 
564 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.15 
 
 
691 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
741 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  38.34 
 
 
712 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.49 
 
 
568 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.05 
 
 
564 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  49 
 
 
552 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 
510 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.36 
 
 
655 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 
694 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
531 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.483034  normal  0.19588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.22 
 
 
563 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.79 
 
 
563 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.64 
 
 
563 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  42.8 
 
 
569 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  45.14 
 
 
675 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.46 
 
 
563 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 
587 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  43 
 
 
697 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  43.21 
 
 
565 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
572 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 
608 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 
736 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
656 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  37.97 
 
 
688 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.03 
 
 
698 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
651 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 
669 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.28 
 
 
665 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0375918  normal  0.509707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  42.19 
 
 
566 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>