More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1177 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1177  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
469 aa  929    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.5025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 
450 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 
449 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0120  chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 
445 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.118781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.93 
 
 
689 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
688 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.23 
 
 
561 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.57 
 
 
688 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 
688 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  47.7 
 
 
656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.96 
 
 
563 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.18 
 
 
676 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  49.82 
 
 
688 aa  210  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  47.54 
 
 
565 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
688 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 
566 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.7 
 
 
586 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.97 
 
 
655 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 
567 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.15 
 
 
428 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
674 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.89 
 
 
564 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  50.18 
 
 
691 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
673 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.87 
 
 
561 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
560 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
731 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
741 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
573 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
562 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
675 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
566 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
670 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  48.19 
 
 
561 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  44.66 
 
 
568 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
655 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
562 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
689 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
566 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.24 
 
 
556 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.45 
 
 
691 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 
563 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 
674 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.76 
 
 
561 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0568  chemotaxis sensory transducer  46.64 
 
 
662 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
656 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.19 
 
 
711 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  44.21 
 
 
712 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
714 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
561 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
567 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  45.92 
 
 
552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.01 
 
 
566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.67 
 
 
697 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  47.4 
 
 
675 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 
712 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
572 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
672 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
681 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
561 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
561 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.71 
 
 
712 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.74 
 
 
561 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
568 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
561 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.58 
 
 
561 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
563 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
561 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
730 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 
686 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.86 
 
 
563 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
681 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.86 
 
 
691 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  44.11 
 
 
561 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.86 
 
 
730 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 
568 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
602 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.37 
 
 
567 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 
556 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.82 
 
 
542 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
562 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.14 
 
 
563 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
563 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  44.21 
 
 
688 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  44.12 
 
 
565 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 
736 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
563 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  44.72 
 
 
565 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
718 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0242034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
445 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
563 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.45 
 
 
587 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.65 
 
 
561 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.39 
 
 
561 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  48.71 
 
 
562 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  46.83 
 
 
561 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
561 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
561 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>