More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0461 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0461  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  100 
 
 
313 aa  641    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  41.9 
 
 
325 aa  260  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  42.04 
 
 
356 aa  242  7e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0163  competence protein CglA  40.89 
 
 
323 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  35.42 
 
 
324 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  35.42 
 
 
324 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1842  ABC transporter  37.06 
 
 
313 aa  188  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  34.35 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  33.43 
 
 
347 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  33.13 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  34.78 
 
 
327 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  33.13 
 
 
347 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  33.13 
 
 
347 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  32.83 
 
 
348 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  32.22 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
596 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  39.13 
 
 
567 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  40.15 
 
 
564 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  33.99 
 
 
348 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  36.82 
 
 
578 aa  170  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  38.19 
 
 
567 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  33.96 
 
 
613 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  34.35 
 
 
597 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
595 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  37.09 
 
 
832 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  37.73 
 
 
603 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  36.33 
 
 
611 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  37.36 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  36.69 
 
 
592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  36.4 
 
 
596 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  36.03 
 
 
604 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  34.35 
 
 
561 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  36.06 
 
 
595 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  37.59 
 
 
507 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.56 
 
 
871 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  32.63 
 
 
600 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
565 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
600 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  36.19 
 
 
560 aa  164  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  35.87 
 
 
582 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  34.64 
 
 
595 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  36.17 
 
 
891 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  37.55 
 
 
583 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  36.06 
 
 
559 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
598 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
598 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  38.41 
 
 
575 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  35.82 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.89 
 
 
558 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.41 
 
 
577 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  33.84 
 
 
557 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  36.9 
 
 
552 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.92 
 
 
599 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.9 
 
 
561 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  35.82 
 
 
605 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  36.9 
 
 
558 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.36 
 
 
562 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  34.93 
 
 
595 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  33.54 
 
 
613 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  36.9 
 
 
594 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  34.93 
 
 
595 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.55 
 
 
599 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  35.02 
 
 
566 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  35.53 
 
 
594 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  37.17 
 
 
493 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  37.17 
 
 
493 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  37.17 
 
 
493 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  35.02 
 
 
566 aa  162  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  35.45 
 
 
585 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  37.17 
 
 
583 aa  161  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  37.17 
 
 
568 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  38.57 
 
 
546 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  36.47 
 
 
574 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  35.38 
 
 
615 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  35.9 
 
 
561 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  34.52 
 
 
570 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  32.82 
 
 
794 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
571 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  36.23 
 
 
462 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  37.36 
 
 
677 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  33.91 
 
 
557 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  35.27 
 
 
462 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  36.8 
 
 
493 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.17 
 
 
599 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  36.8 
 
 
493 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  35.13 
 
 
563 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  34.89 
 
 
557 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
612 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1951  type 4 pili biogenesis protein (nuleotide-binding protein)  35.29 
 
 
517 aa  159  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  35.51 
 
 
585 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  35.51 
 
 
585 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
580 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  35.07 
 
 
514 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  35.27 
 
 
563 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  35.56 
 
 
585 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  36.53 
 
 
599 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  35.66 
 
 
557 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0186  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
360 aa  158  9e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  36.33 
 
 
521 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>