More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1842 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1842  ABC transporter  100 
 
 
313 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0163  competence protein CglA  64.31 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  38.36 
 
 
356 aa  203  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
325 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0461  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  37.06 
 
 
313 aa  188  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  38.75 
 
 
347 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  38.32 
 
 
347 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  37.96 
 
 
348 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  38.32 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  37.96 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  37.96 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  37.96 
 
 
347 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  37.27 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4321  comG operon protein 1  37.59 
 
 
347 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  36.73 
 
 
677 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  35.32 
 
 
348 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
684 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  33.44 
 
 
327 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  34.66 
 
 
587 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  34.91 
 
 
392 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.08 
 
 
603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.69 
 
 
599 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.31 
 
 
599 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  33.7 
 
 
841 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.31 
 
 
599 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
642 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  31.73 
 
 
482 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  33.57 
 
 
547 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  32.61 
 
 
571 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
569 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
553 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  34.72 
 
 
324 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
558 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  31.47 
 
 
568 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  34.72 
 
 
324 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  34.31 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  34.46 
 
 
554 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
505 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2855  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal  0.352738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  35.52 
 
 
604 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  32.21 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  29.45 
 
 
560 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  32.96 
 
 
586 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  32.58 
 
 
562 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  32.49 
 
 
575 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  33.09 
 
 
573 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  31.75 
 
 
549 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0204  type II secretion system protein E  35.87 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  30.94 
 
 
557 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
503 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  34.67 
 
 
571 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  32 
 
 
563 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  35.32 
 
 
491 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 
511 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  32.36 
 
 
566 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
606 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  33.46 
 
 
507 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  35.71 
 
 
501 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  32.18 
 
 
519 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  32.61 
 
 
477 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  33.09 
 
 
578 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  32.42 
 
 
514 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.36 
 
 
558 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  31.02 
 
 
579 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  31.52 
 
 
569 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  33.21 
 
 
471 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  30.6 
 
 
577 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  33.72 
 
 
469 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  32.23 
 
 
461 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0082  type II secretion system protein E  31.29 
 
 
600 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.214348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  32.37 
 
 
770 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  33.08 
 
 
545 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  32.28 
 
 
610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  33.2 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  33.2 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  32.84 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
544 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  32.48 
 
 
469 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  30.14 
 
 
787 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  32.36 
 
 
493 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  30.04 
 
 
645 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  32.71 
 
 
564 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  32.37 
 
 
767 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  32.36 
 
 
493 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  33.83 
 
 
563 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  32.36 
 
 
493 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  29.58 
 
 
574 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
586 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  31.39 
 
 
567 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  30.66 
 
 
586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  32.73 
 
 
577 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
484 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>