More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1275 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  100 
 
 		 356 aa  733    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  44.38 
 
 		 325 aa  279  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0461  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  42.04 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0163  competence protein CglA  39.94 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1842  ABC transporter  38.36 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  41.7 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  42.91 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  42.91 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  42.44 
 
 		 348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  42.54 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  42.44 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  37.98 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  42.54 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0204  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  35.45 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  35.45 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4321  comG operon protein 1  42.16 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 693 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  37.78 
 
 		 693 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.5 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  37.5 
 
 		 461 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  33.44 
 
 		 461 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  37.12 
 
 		 461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  38.96 
 
 		 474 aa  166  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.4 
 
 		 871 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 585 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 684 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 560 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  37.22 
 
 		 491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 677 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  39.07 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  38.72 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  36.88 
 
 		 561 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  35.85 
 
 		 507 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  37.41 
 
 		 562 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 571 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 		 503 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 591 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0543  type II secretion system protein E  38.71 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  36.04 
 
 		 567 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 482 aa  159  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  35.85 
 
 		 551 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  35.96 
 
 		 583 aa  159  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 571 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  32.73 
 
 		 461 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 557 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  36.84 
 
 		 557 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  35.58 
 
 		 538 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 606 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 559 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 577 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  32.37 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  35.98 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  32.37 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.3 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  32.37 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 746 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  36.19 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  34.57 
 
 		 587 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  36.19 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  34.46 
 
 		 585 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  36.19 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  35.98 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  33.33 
 
 		 586 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  35.58 
 
 		 583 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  37.87 
 
 		 547 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 553 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 586 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.33 
 
 		 558 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  35.27 
 
 		 832 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 463 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  32.01 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 586 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  37.59 
 
 		 484 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 586 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 586 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  36.19 
 
 		 497 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  35.93 
 
 		 515 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  33.57 
 
 		 559 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 586 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2313  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  36.19 
 
 		 497 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 561 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  34.57 
 
 		 586 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  34.7 
 
 		 557 aa  155  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  34.57 
 
 		 584 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  33.45 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  38.31 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>