More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0553 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0553  type II secretion system protein E  100 
 
 		 325 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1275  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  44.38 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0461  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  41.9 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0163  competence protein CglA  39.68 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1842  ABC transporter  39.2 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  38.38 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  37.23 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  38.16 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  37.81 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  37.81 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  37.81 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  38.52 
 
 		 348 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  37.46 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  35.85 
 
 		 560 aa  176  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.29 
 
 		 558 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  36.88 
 
 		 571 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  35.93 
 
 		 461 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 461 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 553 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  35.93 
 
 		 461 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  37.12 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  32.94 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  35.85 
 
 		 501 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  36.23 
 
 		 469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  35.98 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  33.09 
 
 		 462 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1951  type 4 pili biogenesis protein (nuleotide-binding protein)  37.22 
 
 		 517 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  32.19 
 
 		 806 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0247  type IV-A pilus assembly protein PilB  37.78 
 
 		 516 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  37.88 
 
 		 573 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  33.09 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 566 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  34.91 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 568 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  34.39 
 
 		 547 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0204  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 561 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 885 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  33.46 
 
 		 557 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  36.02 
 
 		 551 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  35.42 
 
 		 462 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  35.42 
 
 		 462 aa  158  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  35.61 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  36.98 
 
 		 563 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 553 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 548 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 552 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  32.09 
 
 		 461 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 556 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  34.22 
 
 		 507 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1442  type II secretion system protein E  34.57 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  35.61 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  32.83 
 
 		 562 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4321  comG operon protein 1  38.15 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1755  general secretory pathway protein E  35.23 
 
 		 462 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571927  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  35.85 
 
 		 474 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  32.09 
 
 		 461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  32.71 
 
 		 577 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  32.09 
 
 		 461 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 888 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  34.46 
 
 		 871 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  34.72 
 
 		 515 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  32.09 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  31.82 
 
 		 461 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 568 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 557 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  33.94 
 
 		 498 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  34.13 
 
 		 469 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  34.21 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  34.21 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  31.72 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  35.98 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 599 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  33.85 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 603 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  34.21 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  35.47 
 
 		 471 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  33.21 
 
 		 585 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  34.72 
 
 		 498 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  35.23 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.71 
 
 		 599 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  33.08 
 
 		 523 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 497 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  34.22 
 
 		 561 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 550 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0186  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  35.09 
 
 		 495 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  33.45 
 
 		 600 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>