More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1109 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1109  competence protein ComGA, putative  100 
 
 		 327 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.140305  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1602  type II secretion system protein E  69.75 
 
 		 324 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0174224  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1636  type II secretion system protein E  69.75 
 
 		 324 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0198481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  40.37 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  40.59 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 347 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  40.37 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  40.37 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  40.37 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  39.85 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  37.45 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  38.18 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.25 
 
 		 558 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  41.76 
 
 		 583 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  41.03 
 
 		 583 aa  191  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  40 
 
 		 598 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0204  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.82 
 
 		 557 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.97 
 
 		 787 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  34.7 
 
 		 566 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  36.1 
 
 		 553 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 561 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  37.36 
 
 		 585 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.17 
 
 		 564 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.96 
 
 		 553 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  39.1 
 
 		 462 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 556 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0461  Type II secretory pathway/competence component, ATPase  34.78 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 569 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.37 
 
 		 559 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  38.83 
 
 		 583 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 482 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.13 
 
 		 871 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0392  putative type II protein secretion system E protein CtsE  37.84 
 
 		 504 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  37 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0163  competence protein CglA  37.09 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  36.9 
 
 		 560 aa  176  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  37 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  38.58 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  37 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 570 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 554 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 563 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 567 aa  176  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4321  comG operon protein 1  39.63 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  36.63 
 
 		 461 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  36.63 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  36.63 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  37.41 
 
 		 585 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.93 
 
 		 574 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  36.63 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  36.98 
 
 		 582 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  34.69 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.67 
 
 		 561 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 527 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 885 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  33.92 
 
 		 569 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 577 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 503 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 561 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 568 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  33.9 
 
 		 461 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  35.79 
 
 		 558 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.3 
 
 		 562 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 637 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  35.93 
 
 		 477 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  34.07 
 
 		 515 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 577 aa  172  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.3 
 
 		 563 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.01 
 
 		 568 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 505 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  36.4 
 
 		 586 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  35.16 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  35.04 
 
 		 577 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 888 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  34.63 
 
 		 499 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  33.82 
 
 		 495 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5698  general secretory pathway protein E  34.51 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 586 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  33.88 
 
 		 610 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  34.56 
 
 		 498 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 561 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 586 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 586 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  36.57 
 
 		 572 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  33.82 
 
 		 522 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1430  pilin/fimbriae biogenesis protein  35.53 
 
 		 471 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  34.56 
 
 		 499 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  34.56 
 
 		 499 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  36.03 
 
 		 587 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  35.69 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 499 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  34.56 
 
 		 499 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  34.56 
 
 		 499 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  36.03 
 
 		 521 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>