More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1571 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  100 
 
 
587 aa  1184    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
558 aa  445  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.47 
 
 
558 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
787 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.21 
 
 
553 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
599 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.65 
 
 
599 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.18 
 
 
564 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.18 
 
 
599 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
570 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.76 
 
 
555 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.76 
 
 
871 aa  418  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.53 
 
 
553 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.33 
 
 
603 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.61 
 
 
571 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  47.43 
 
 
520 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.09 
 
 
553 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.04 
 
 
553 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.88 
 
 
554 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 
521 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  47.23 
 
 
520 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.86 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.99 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43.08 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
573 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
570 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.59 
 
 
557 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  43.52 
 
 
577 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  42.15 
 
 
559 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.91 
 
 
514 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.68 
 
 
568 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.68 
 
 
568 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.68 
 
 
573 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.63 
 
 
520 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.07 
 
 
571 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.71 
 
 
561 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40 
 
 
568 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  36.83 
 
 
560 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.5 
 
 
568 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.96 
 
 
578 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.47 
 
 
885 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.03 
 
 
568 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  43.42 
 
 
578 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.49 
 
 
567 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
891 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  41.43 
 
 
572 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.04 
 
 
556 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  37.75 
 
 
562 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.42 
 
 
563 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.69 
 
 
563 aa  392  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.78 
 
 
575 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.83 
 
 
568 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.34 
 
 
571 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.68 
 
 
558 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.77 
 
 
568 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.99 
 
 
557 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  40.96 
 
 
564 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.84 
 
 
568 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.46 
 
 
566 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40 
 
 
568 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  39.26 
 
 
552 aa  385  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  39.43 
 
 
568 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.21 
 
 
571 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.61 
 
 
577 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.18 
 
 
888 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.07 
 
 
568 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
563 aa  382  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.03 
 
 
561 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.56 
 
 
577 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  40.79 
 
 
557 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  39.36 
 
 
561 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  41.91 
 
 
514 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  39.19 
 
 
746 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  39 
 
 
806 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.28 
 
 
565 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
577 aa  379  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.75 
 
 
585 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  39.68 
 
 
566 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.06 
 
 
561 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  40.24 
 
 
570 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  38.97 
 
 
567 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.47 
 
 
586 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
568 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  42.97 
 
 
515 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  40.21 
 
 
577 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.72 
 
 
561 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.24 
 
 
569 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  51.6 
 
 
469 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.39 
 
 
563 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  51.86 
 
 
469 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
571 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  43.45 
 
 
521 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  48.58 
 
 
521 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  48.58 
 
 
521 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  40.32 
 
 
569 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  48.58 
 
 
521 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.86 
 
 
569 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  39.81 
 
 
562 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  41.82 
 
 
524 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.24 
 
 
549 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>