More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0965 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  100 
 
 
152 aa  294  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  65.96 
 
 
153 aa  181  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  65.49 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  62.07 
 
 
151 aa  169  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  59.72 
 
 
154 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  44.08 
 
 
152 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  42.86 
 
 
180 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  39.01 
 
 
150 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.14 
 
 
152 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  43.15 
 
 
158 aa  97.1  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.17 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  41.73 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  40.28 
 
 
150 aa  92  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  38.41 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.75 
 
 
290 aa  88.6  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38.46 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.62 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  41.61 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  42.25 
 
 
294 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.38 
 
 
307 aa  87.8  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.33 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  41.13 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  36.88 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  41.96 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  35.09 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  39.19 
 
 
288 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  37.14 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  42.75 
 
 
301 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  34.01 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  38.41 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.64 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  43.17 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.58 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  37.5 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.81 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  40.14 
 
 
280 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  36.88 
 
 
320 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  39.29 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.73 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  37.25 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  37.33 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  40.14 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.5 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.37 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  37.67 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.39 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.27 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.26 
 
 
286 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.03 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.37 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.37 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  37.59 
 
 
207 aa  77  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  33.99 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  40.56 
 
 
415 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  31.58 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.13 
 
 
287 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.16 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.79 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.57 
 
 
297 aa  74.7  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.52 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.57 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  36.67 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  33.1 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  40.71 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  39.87 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  37.59 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  36.11 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.32 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.78 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.47 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  32.45 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.8 
 
 
295 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  34.44 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  35 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.62 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  39.57 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>