124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0499 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  44.28 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  44.03 
 
 		 202 aa  128  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 298 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 269 aa  101  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  27.6 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 418 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  23.64 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.07 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 349 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  29.91 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  27.54 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  28.04 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  21.56 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  24.48 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3253  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 246 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  27.68 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  27.68 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  27.68 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 208 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  27.68 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 437 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  23.27 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>