98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0138 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  100 
 
 
937 aa  1731    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  48.37 
 
 
1000 aa  246  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  40.88 
 
 
1434 aa  230  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  41.52 
 
 
1827 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  39.63 
 
 
702 aa  196  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.54 
 
 
11716 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  37.16 
 
 
640 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.33 
 
 
1433 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.41 
 
 
1437 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  35.24 
 
 
1337 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  42.25 
 
 
830 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  34.89 
 
 
621 aa  154  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  35.78 
 
 
1348 aa  152  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.75 
 
 
2507 aa  150  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  31.73 
 
 
1346 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  40.91 
 
 
504 aa  135  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  47.14 
 
 
2313 aa  131  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.62 
 
 
1073 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  51.53 
 
 
1394 aa  121  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  33.91 
 
 
503 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  44.52 
 
 
617 aa  114  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  29.34 
 
 
648 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  32.72 
 
 
706 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  37.78 
 
 
590 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  33.9 
 
 
818 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.87 
 
 
752 aa  95.5  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.96 
 
 
749 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  43.27 
 
 
840 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  26.08 
 
 
2064 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  34.75 
 
 
885 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  42.63 
 
 
625 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  42.97 
 
 
555 aa  80.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  40.29 
 
 
551 aa  75.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  47.79 
 
 
136 aa  74.3  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  31.88 
 
 
671 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  32.11 
 
 
935 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  43.58 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  43.18 
 
 
1096 aa  68.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3146  hypothetical protein  39.52 
 
 
1476 aa  67.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1526  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  53.33 
 
 
411 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597121  normal  0.0174426 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54178  glycoprotein precursor  21.43 
 
 
863 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  27.11 
 
 
819 aa  66.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  33.71 
 
 
854 aa  65.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  27.95 
 
 
687 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  24.45 
 
 
811 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.3 
 
 
916 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  36.13 
 
 
633 aa  61.6  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  32.68 
 
 
354 aa  61.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  37.06 
 
 
605 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  33.33 
 
 
479 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  37.19 
 
 
582 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  33.43 
 
 
329 aa  58.9  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48.94 
 
 
846 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  43.64 
 
 
2353 aa  57.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1165  serine/threonine protein kinase  57.63 
 
 
713 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.44 
 
 
1567 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.59 
 
 
261 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  20 
 
 
1461 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0111  hypothetical protein  26.32 
 
 
1165 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  43.55 
 
 
1217 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  33.57 
 
 
521 aa  55.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  40.3 
 
 
735 aa  54.7  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47260  predicted protein  27.78 
 
 
398 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776237  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  37.29 
 
 
467 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1620  hypothetical protein  43.48 
 
 
441 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  35.14 
 
 
458 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1527  hypothetical protein  70.45 
 
 
229 aa  53.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0816972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  38.33 
 
 
458 aa  51.6  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  33.95 
 
 
611 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47575  predicted protein  33.99 
 
 
744 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.759441  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  38.1 
 
 
472 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  43.51 
 
 
639 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  45.65 
 
 
128 aa  48.5  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54658  predicted protein  35.24 
 
 
422 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000768502  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_8596  predicted protein  43.75 
 
 
70 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_8538  predicted protein  43.75 
 
 
70 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  35.92 
 
 
500 aa  48.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2486  S-antigen family protein  28.96 
 
 
467 aa  48.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.13457  normal  0.608286 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  37.5 
 
 
488 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  48.05 
 
 
433 aa  48.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8537  predicted protein  44.26 
 
 
65 aa  47.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400329  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11401  predicted protein  42.11 
 
 
116 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3648  hypothetical protein  26.1 
 
 
1616 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1002  hypothetical protein  34.65 
 
 
718 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0783  helicase domain protein  37.88 
 
 
987 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000205991  normal  0.0820229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.93 
 
 
1537 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  24.68 
 
 
1240 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  30.53 
 
 
428 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.99 
 
 
466 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.04 
 
 
676 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  46.43 
 
 
259 aa  45.1  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  37.5 
 
 
1706 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  27.7 
 
 
706 aa  44.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  32.84 
 
 
755 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4658  mucin 2  46.32 
 
 
794 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0296531  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50357  predicted protein  31.07 
 
 
789 aa  44.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  26.02 
 
 
926 aa  44.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  52.54 
 
 
914 aa  44.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>