16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1002 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1363    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  76.67 
 
 		 639 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1287  hypothetical protein  39.05 
 
 		 305 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.856161  normal  0.340311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3112  hypothetical protein  31 
 
 		 636 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4641  hypothetical protein  28.54 
 
 		 810 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0331671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  34.93 
 
 		 500 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  35.79 
 
 		 2179 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.06 
 
 		 830 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.94 
 
 		 2449 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  46.85 
 
 		 605 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  29.1 
 
 		 909 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.51 
 
 		 453 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.81 
 
 		 2313 aa  47.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  56.34 
 
 		 846 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  31.98 
 
 		 301 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.83 
 
 		 671 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>