12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_54178 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_54178  glycoprotein precursor  100 
 
 		 863 aa  1649    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.148187  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  33.15 
 
 		 1000 aa  82  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  36.51 
 
 		 329 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  36.39 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  27.82 
 
 		 840 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  25.37 
 
 		 504 aa  55.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  34.71 
 
 		 854 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  33.04 
 
 		 648 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  32.03 
 
 		 136 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  38.31 
 
 		 1567 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  32.41 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.03 
 
 		 2313 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>