19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1620 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3418  hypothetical protein  74.59 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  46.75 
 
 		 1159 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52.85 
 
 		 830 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  44.59 
 
 		 1394 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  33.21 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  50.34 
 
 		 2353 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.32 
 
 		 2313 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  36.92 
 
 		 916 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  41.57 
 
 		 625 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  44.59 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  44.14 
 
 		 778 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  32.93 
 
 		 840 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  55.71 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  39.36 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3858  rhs element Vgr protein  42.08 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  31.89 
 
 		 1000 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  44.07 
 
 		 617 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  45.59 
 
 		 605 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>