19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3418 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  823    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1620  hypothetical protein  73.19 
 
 		 441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  48.63 
 
 		 830 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  48 
 
 		 2353 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  55.77 
 
 		 1159 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  46.95 
 
 		 1394 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  44.79 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  42.2 
 
 		 2313 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 778 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.7 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  33.79 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  37.06 
 
 		 551 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  37.38 
 
 		 671 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  46.1 
 
 		 605 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  28.57 
 
 		 1000 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  56.52 
 
 		 942 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0233  hypothetical protein  34.51 
 
 		 813 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  39.11 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  35.54 
 
 		 489 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>