16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8538 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_8596  predicted protein  100 
 
 
70 aa  117  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_8538  predicted protein  100 
 
 
70 aa  117  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  41.27 
 
 
590 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  42.03 
 
 
1000 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_8543  predicted protein  47.76 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  38.81 
 
 
840 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  45.71 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  50.94 
 
 
551 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8537  predicted protein  39.29 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400329  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43595  predicted protein  47.89 
 
 
329 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.796402  normal  0.0151385 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  43.4 
 
 
1217 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47888  predicted protein  43.94 
 
 
854 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.554333  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11401  predicted protein  53.12 
 
 
116 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121452  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  42.67 
 
 
504 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4084  PT repeat-containing protein  57.14 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000901223  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43691  predicted protein  44.93 
 
 
354 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183589  normal  0.0384489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>