208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1707 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
846 aa  1683    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
868 aa  234  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 
2741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 
2741 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
916 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.79 
 
 
717 aa  121  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  25.64 
 
 
891 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.72 
 
 
1009 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  38.04 
 
 
192 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  37.89 
 
 
827 aa  98.6  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  30.38 
 
 
809 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  24.67 
 
 
893 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.15 
 
 
957 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
1162 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.86 
 
 
1007 aa  92.8  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.94 
 
 
1162 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.3 
 
 
532 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
994 aa  88.2  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
828 aa  87.8  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 
880 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 
1060 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.2 
 
 
968 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  23.99 
 
 
884 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.97 
 
 
991 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.98 
 
 
919 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
1711 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  34.04 
 
 
873 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
874 aa  82.8  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  22.88 
 
 
1219 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  29.5 
 
 
959 aa  82.8  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 
1186 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
851 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
822 aa  81.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  28.44 
 
 
371 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
854 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
937 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  32.61 
 
 
905 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  29.39 
 
 
845 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.2 
 
 
1328 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.62 
 
 
910 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  30.77 
 
 
811 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.55 
 
 
3537 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
923 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  30.36 
 
 
1051 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  35.29 
 
 
890 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  27.3 
 
 
1051 aa  76.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
851 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  34.5 
 
 
890 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  27.45 
 
 
1228 aa  75.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
729 aa  75.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
883 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  26.38 
 
 
1058 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  26.5 
 
 
1025 aa  75.1  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.22 
 
 
3298 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
1215 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  26.21 
 
 
1247 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  36.88 
 
 
565 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.52 
 
 
903 aa  74.7  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.5 
 
 
992 aa  74.7  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  23.66 
 
 
853 aa  74.3  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.91 
 
 
3535 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.91 
 
 
3419 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  35.91 
 
 
1024 aa  73.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  32.57 
 
 
897 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  34.34 
 
 
840 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.99 
 
 
3299 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  32.27 
 
 
848 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  34.13 
 
 
960 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  34.21 
 
 
1475 aa  71.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1025 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 
1266 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  33.54 
 
 
1241 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
1409 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.23 
 
 
2637 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 
1544 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  36.25 
 
 
909 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  31.19 
 
 
1077 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
1276 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  31.69 
 
 
595 aa  67.4  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
796 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  31.76 
 
 
447 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 
1507 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
1621 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.1 
 
 
854 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.69 
 
 
1020 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.17 
 
 
418 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  29.65 
 
 
553 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
1247 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
905 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  31.58 
 
 
918 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
905 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.41 
 
 
1238 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
1276 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
868 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
1036 aa  65.1  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 
928 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  24.74 
 
 
944 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  31.94 
 
 
1039 aa  64.3  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1779 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  30.2 
 
 
775 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>