267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2840 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  49.32 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  46.82 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  47.2 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.39 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.1 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  26.12 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  29.1 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 283 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.92 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 343 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  28.38 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.63 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  28.09 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  36.24 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  37.31 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>