138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1589 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  325  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2118  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  34.82 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  31.03 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  33.73 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  22.95 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  32.22 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.58 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  31.25 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 191 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2187  hypothetical protein  32.08 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0800441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  40 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  43.4 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  31.45 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  42.47 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6111  regulatory protein, MarR  46.43 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1341  transcriptional regulator, TrmB  20 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3735  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 366 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.090934  normal  0.79067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>