More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0700 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  36.98 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 194 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 212 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  40.65 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  36.62 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  42.19 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32.53 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  27.69 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.7 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.7 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.7 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  30.23 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>