More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4011 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
418 aa  841    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.139178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
435 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  40 
 
 
505 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
969 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  41.57 
 
 
503 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
674 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
1029 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
493 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
683 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
538 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 
1060 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
678 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
1172 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
478 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
1339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  36.58 
 
 
881 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  33.25 
 
 
931 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
829 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  36.47 
 
 
573 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
1153 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
827 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
550 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
681 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
774 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  37 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
526 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  38.29 
 
 
700 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.45 
 
 
1499 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3133  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
543 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.863254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
628 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
799 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
659 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
911 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  40.15 
 
 
553 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  33.24 
 
 
1093 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
775 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
922 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
809 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
568 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
817 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
716 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  35.17 
 
 
812 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
786 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
770 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  38.29 
 
 
515 aa  172  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
1010 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
558 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
799 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
531 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  38.74 
 
 
462 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
828 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
1140 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
528 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  30.75 
 
 
723 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0324  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
424 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.046409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1067  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
666 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 
723 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 
723 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
789 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 
821 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 
821 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 
723 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 
821 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
713 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
775 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
929 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
1195 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
368 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
575 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
1807 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
571 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
710 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
1669 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
656 aa  167  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
960 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  35.11 
 
 
490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
643 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
677 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
626 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
1013 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
729 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  38.84 
 
 
776 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
821 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
529 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
594 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  33.94 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
869 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
502 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
767 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2084  sensor for ctr capsule biosynthesis; sensor histidine kinase  35.19 
 
 
660 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
506 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
973 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
883 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
1020 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
683 aa  162  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  35.52 
 
 
492 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>