More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3324 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 972 aa  1976    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  43.89 
 
 		 1132 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  36.33 
 
 		 1657 aa  343  8e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.09 
 
 		 1029 aa  231  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  46.74 
 
 		 263 aa  227  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  31.59 
 
 		 999 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  31.59 
 
 		 999 aa  193  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  31.26 
 
 		 999 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  28.46 
 
 		 712 aa  182  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  27.48 
 
 		 841 aa  178  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  42.54 
 
 		 801 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.64 
 
 		 396 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  33.02 
 
 		 342 aa  128  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.54 
 
 		 585 aa  126  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 422 aa  123  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  32.13 
 
 		 461 aa  120  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.86 
 
 		 892 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.63 
 
 		 450 aa  119  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  34.33 
 
 		 391 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.36 
 
 		 1200 aa  119  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.67 
 
 		 387 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.04 
 
 		 451 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.56 
 
 		 455 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  42.36 
 
 		 798 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.31 
 
 		 442 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  112  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.14 
 
 		 367 aa  112  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.42 
 
 		 945 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.95 
 
 		 570 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.76 
 
 		 360 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.25 
 
 		 414 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.07 
 
 		 392 aa  109  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.52 
 
 		 809 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.22 
 
 		 953 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  33.44 
 
 		 371 aa  106  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.36 
 
 		 1295 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  32.41 
 
 		 381 aa  105  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.7 
 
 		 388 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  33.16 
 
 		 408 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 		 390 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.4 
 
 		 460 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.02 
 
 		 360 aa  100  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  27.03 
 
 		 419 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.2 
 
 		 2172 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 427 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  35.45 
 
 		 389 aa  99  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  24.46 
 
 		 918 aa  98.2  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  37.42 
 
 		 524 aa  97.8  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 410 aa  97.4  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  24.3 
 
 		 909 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 		 406 aa  96.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  32.62 
 
 		 400 aa  96.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 369 aa  97.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  96.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  29.43 
 
 		 374 aa  96.3  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.95 
 
 		 933 aa  96.3  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 		 392 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  34.35 
 
 		 363 aa  94.7  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.12 
 
 		 377 aa  95.1  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.88 
 
 		 388 aa  94.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  23.37 
 
 		 984 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  24.87 
 
 		 395 aa  94.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  24.49 
 
 		 395 aa  94.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  30.45 
 
 		 404 aa  94.4  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.09 
 
 		 1182 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  26.79 
 
 		 376 aa  94.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 		 388 aa  93.6  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.58 
 
 		 918 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00896  dehydrogenase  33.48 
 
 		 394 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.34 
 
 		 1338 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 		 377 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.06 
 
 		 729 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  28.05 
 
 		 428 aa  91.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1304  hypothetical protein  30.86 
 
 		 405 aa  91.3  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  26.73 
 
 		 388 aa  91.3  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  28.05 
 
 		 428 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  27.27 
 
 		 369 aa  90.5  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  29.77 
 
 		 855 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  26.89 
 
 		 384 aa  90.1  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.95 
 
 		 385 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  33.85 
 
 		 630 aa  90.1  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  32.21 
 
 		 385 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 		 394 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  32.73 
 
 		 365 aa  90.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  28.18 
 
 		 676 aa  89.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  32.21 
 
 		 385 aa  89  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  37.24 
 
 		 1234 aa  89  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  32.86 
 
 		 442 aa  89  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.27 
 
 		 1505 aa  88.6  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 		 382 aa  88.6  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  26.4 
 
 		 374 aa  88.2  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 		 443 aa  88.2  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  25.22 
 
 		 1138 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  26.26 
 
 		 371 aa  87.8  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  26.26 
 
 		 371 aa  87.8  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  26.26 
 
 		 371 aa  87.4  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  23.36 
 
 		 1143 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.16 
 
 		 500 aa  87  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  29.51 
 
 		 482 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 		 1321 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>