More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1842 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  100 
 
 
442 aa  875    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  32.37 
 
 
442 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  32.43 
 
 
448 aa  226  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
451 aa  210  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29.48 
 
 
453 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  30.62 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  31.92 
 
 
457 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  31.37 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  30.39 
 
 
477 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
522 aa  193  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
448 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  29.41 
 
 
458 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  30.56 
 
 
453 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  29.65 
 
 
446 aa  187  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
445 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  30.32 
 
 
500 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
449 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
494 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  32.82 
 
 
408 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  29.39 
 
 
443 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.34 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
469 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  31.17 
 
 
496 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.19 
 
 
485 aa  143  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  27.87 
 
 
468 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
454 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
453 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  29.68 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  29.68 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  30.1 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.16 
 
 
486 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.85 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.59 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.75 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.59 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.59 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  29.19 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.59 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.34 
 
 
469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.07 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.38 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.24 
 
 
500 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
472 aa  126  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
518 aa  126  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
455 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.34 
 
 
490 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
486 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.78 
 
 
469 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
471 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  28.99 
 
 
524 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  29.84 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
521 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.01 
 
 
453 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.34 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.77 
 
 
463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  29.14 
 
 
503 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.59 
 
 
485 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
451 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
538 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  23.74 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  25.4 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  29.03 
 
 
454 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
447 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.62 
 
 
456 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
447 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  24.38 
 
 
447 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
454 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.66 
 
 
477 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
454 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
525 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  23.92 
 
 
462 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
460 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.36 
 
 
460 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.3 
 
 
503 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.4 
 
 
437 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
481 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
449 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
447 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
554 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  26.75 
 
 
460 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
453 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.1 
 
 
451 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.4 
 
 
437 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.54 
 
 
458 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>