210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0892 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  818    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  40.64 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  31.55 
 
 		 423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  28.18 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  29.94 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  27.12 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.16 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0616  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0461422  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  26.98 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  30.05 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.09 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  22.53 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.29 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2513  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  24.61 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  25.68 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0498  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000266788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  29.91 
 
 		 498 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  25.27 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  25.93 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4939  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.6 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  26.46 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3204  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  36.54 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  29.06 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3378  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  28.08 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  25.32 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  28.92 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  24.05 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5059  major facilitator transporter  28.1 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0787973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.08 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  25.81 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  36.47 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>