66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0498 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0498  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  794    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000266788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04370  putative MFS transporter  42.93 
 
 
413 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0426  MFS family transporter  42.67 
 
 
399 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.42 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2900  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.21 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.16 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  23.1 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.01 
 
 
440 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  28.4 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  23.98 
 
 
421 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2341  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  26.48 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  26.48 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
430 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
424 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 
592 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 
403 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  26.88 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  26.09 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  26.84 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.77 
 
 
607 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  23.56 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  28.57 
 
 
539 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  23 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.53 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.26 
 
 
424 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  26.67 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  19.94 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3110  major facilitator transporter  25.17 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  22.83 
 
 
434 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 
615 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  24.06 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.18 
 
 
429 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  24.06 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  23.36 
 
 
430 aa  44.3  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  31.91 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  25.27 
 
 
421 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  24.06 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  24.06 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 
624 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  24.15 
 
 
403 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.42 
 
 
444 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 
523 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1299  major facilitator transporter  31.03 
 
 
479 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  23.81 
 
 
417 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 
413 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  25.1 
 
 
409 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>