More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0566 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0566  diguanylate cyclase  100 
 
 		 349 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5208  diguanylate cyclase  28.02 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  29.95 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  29.01 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5111  hypothetical protein  25.14 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5094  hypothetical protein  25.56 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5509  GGDEF domain protein  25.42 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5267  GGDEF domain-containing protein  25.42 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5664  GGDEF domain-containing protein  25.42 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5543  GGDEF domain-containing protein  26.04 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 566 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5538  ggdef family protein  27.2 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5414  ggdef family protein  26.32 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5594  GGDEF domain protein  26.26 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0891  diguanylate cyclase  35.45 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4086  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.86 
 
 		 820 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 569 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1352  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.86 
 
 		 818 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  43.2 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  40.51 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0406  periplasmic sensor diguanylate cyclase (GGDEF)  33.83 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.08 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1742  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 259 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0534167  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1761  sensory box protein/GGDEF family protein  42.26 
 
 		 973 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  41.15 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.26 
 
 		 818 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260128  decreased coverage  0.0078854 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 487 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3474  diguanylate cyclase  39.81 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2060  diguanylate cyclase  33.83 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1081  diguanylate cyclase  34.83 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  34.48 
 
 		 320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  40.62 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0995  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.51 
 
 		 762 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.304607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.84 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4965  diguanylate cyclase  34.51 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00367568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0835  diguanylate cyclase  29.68 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4872  diguanylate cyclase  34.51 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000065621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4907  diguanylate cyclase  34.51 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0301785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4959  diguanylate cyclase  34.51 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0525  GGDEF family protein  32.49 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  39.16 
 
 		 574 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 493 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00827  hypothetical protein  42.68 
 
 		 626 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003591  GGDEF family protein  36.22 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3509  diguanylate cyclase  37.99 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3638  diguanylate cyclase  37.99 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.882001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1997  diguanylate cyclase  27.61 
 
 		 366 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0645  diguanylate cyclase  31.06 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.588566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.51 
 
 		 730 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0843  diguanylate cyclase  37.99 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0034  diguanylate cyclase  43.11 
 
 		 433 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523887  normal  0.941955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4804  diguanylate cyclase  34.8 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0452209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  40.36 
 
 		 650 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.2 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 572 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.52 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1025  diguanylate cyclase  36.28 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  42.07 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001647  sensory box/GGDEF family protein  43.29 
 
 		 626 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1021  diguanylate cyclase  36.28 
 
 		 492 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4658  hypothetical protein  39.88 
 
 		 818 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40570  putative two-component response regulator  40.65 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  36.15 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  44.31 
 
 		 565 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3816  diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 526 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  38.46 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  43.45 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1336  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0220322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  36.27 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  40.61 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53140  hypothetical protein  40.12 
 
 		 823 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  45.68 
 
 		 498 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01027  predicted diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 764 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3752  diguanylate cyclase  40 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3627  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 526 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 764 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2328  diguanylate cyclase  31.23 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01034  hypothetical protein  36.14 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  42.17 
 
 		 764 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  43.4 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  41.88 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6178  diguanylate cyclase  37.39 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1267  diguanylate cyclase (GGDEF) domain protein  36.14 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.413897 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1901  diguanylate cyclase  37.39 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2617  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.885697  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1739  GGDEF domain protein  45 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2571  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0240912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.35 
 
 		 818 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.567434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1145  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1143  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.011762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.11 
 
 		 557 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6549  diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 546 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1211  diguanylate cyclase  39.63 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0489  diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>