144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1687 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 516 aa  1057    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  42.33 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  40.57 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  33.51 
 
 		 286 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  22.46 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  27 
 
 		 424 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  27.1 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  28.95 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  41.03 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  35.85 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  48.08 
 
 		 168 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.86 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0377  hypothetical protein  21.03 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  22.7 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  25.83 
 
 		 217 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  22.7 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  31.36 
 
 		 303 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  34.74 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  22.7 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.48 
 
 		 440 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.01 
 
 		 499 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  33.01 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 556 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  34.29 
 
 		 542 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 341 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 539 aa  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  32.5 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  34.23 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  53.33 
 
 		 571 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  46.3 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  37.5 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  30.83 
 
 		 557 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  42.47 
 
 		 650 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.31 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  43.18 
 
 		 595 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  47.83 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.4 
 
 		 579 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  43.64 
 
 		 405 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  32.58 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2191  Peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 191 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 618 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  41.07 
 
 		 563 aa  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 		 849 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.11 
 
 		 576 aa  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.19 
 
 		 303 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  42.11 
 
 		 389 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.1 
 
 		 271 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.51 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 338 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  24.41 
 
 		 481 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 555 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  39.13 
 
 		 377 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.68 
 
 		 581 aa  47.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  31.65 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  40.43 
 
 		 471 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  39.66 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2670  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.55 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.2261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  40.68 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.16 
 
 		 435 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.39 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  46.51 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  26.02 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.89 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  46.67 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  51.16 
 
 		 324 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.73 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  31.13 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.19 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  41.94 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3975  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.45 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2127  GDSL family lipase  26.21 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  41.67 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  41.67 
 
 		 372 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000116248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 631 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.72 
 
 		 637 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.65 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  36.23 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 554 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3713  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000484801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  45.24 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  47.73 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.46 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1368  peptidoglycan-binding protein  37.29 
 
 		 159 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0555  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000230448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  30.85 
 
 		 265 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  30.85 
 
 		 265 aa  45.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 473 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000747673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3142  hypothetical protein  30.86 
 
 		 237 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.917118  normal  0.0747759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  38.98 
 
 		 530 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  48.89 
 
 		 384 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  43.75 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>