12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1219 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  993    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1686  hypothetical protein  40.66 
 
 		 589 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000237828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2480  hypothetical protein  35.34 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0247  hypothetical protein  36.24 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  30.82 
 
 		 482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0377  hypothetical protein  25.41 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  25.54 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  22.34 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  29.45 
 
 		 473 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  25.56 
 
 		 286 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  24.41 
 
 		 516 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  29.69 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>