14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0377 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0377  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  1014    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  25.41 
 
 
481 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0247  hypothetical protein  23.9 
 
 
490 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1686  hypothetical protein  24.52 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000237828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2480  hypothetical protein  21.45 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  23.06 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  20.6 
 
 
482 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  22.89 
 
 
412 aa  57  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  20.78 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  21.03 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  22.62 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  22.62 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  22.62 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  32.2 
 
 
286 aa  43.5  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>