20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0017 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  813    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4627  hypothetical protein  29.08 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  25.14 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  26.03 
 
 
392 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  25.77 
 
 
392 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  25.77 
 
 
392 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  22.46 
 
 
516 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  26.62 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  22.34 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  20.6 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  26.01 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0377  hypothetical protein  23.06 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  24.02 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0247  hypothetical protein  23.24 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1686  hypothetical protein  22.38 
 
 
589 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000237828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  20.87 
 
 
482 aa  59.7  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2480  hypothetical protein  21.97 
 
 
470 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  23.33 
 
 
286 aa  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.56 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  24.12 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>