18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1686 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1686  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1220    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000237828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0247  hypothetical protein  50.63 
 
 
490 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  40.66 
 
 
481 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2480  hypothetical protein  30.25 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  30.85 
 
 
482 aa  140  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0377  hypothetical protein  24.52 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  21.5 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  22.38 
 
 
392 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1356  hypothetical protein  26.92 
 
 
156 aa  58.9  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3204  hypothetical protein  21.69 
 
 
141 aa  50.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4142  hypothetical protein  22.78 
 
 
167 aa  49.7  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0201684  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  29.32 
 
 
188 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  29.32 
 
 
188 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  29.32 
 
 
188 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  29.32 
 
 
188 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0983  hypothetical protein  24.32 
 
 
331 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 
516 aa  43.5  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>