14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0638 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  98.98 
 
 
392 aa  779    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  787    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  98.21 
 
 
392 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  25.77 
 
 
392 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  21.61 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  22.46 
 
 
424 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  23.35 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  24.15 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  22.7 
 
 
516 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  27.97 
 
 
189 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4627  hypothetical protein  20.32 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1886  lysophospholipase L1 related esterase  27.48 
 
 
187 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0377  hypothetical protein  22.62 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  20.11 
 
 
482 aa  42.7  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>