12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1220 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  890    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  27.64 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 		 516 aa  86.7  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  26.13 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  26.62 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  29.83 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4627  hypothetical protein  23.1 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  21.58 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  22.46 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  22.46 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  22.34 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  21.8 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>