12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3459 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  939    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4627  hypothetical protein  42.73 
 
 		 407 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  29.26 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  25.28 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  26.01 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  26.85 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  31.4 
 
 		 473 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  22.34 
 
 		 424 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  24.38 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  26.14 
 
 		 286 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  27.93 
 
 		 481 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>