95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0246 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 473 aa  974    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  42.33 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  38.33 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  26.13 
 
 		 424 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  30 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  23.95 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  24.02 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4627  hypothetical protein  19.77 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.17 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  62.79 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1686  hypothetical protein  39.58 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000237828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  39.29 
 
 		 571 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 546 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  34.67 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 		 631 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.04 
 
 		 581 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 		 593 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 		 637 aa  53.9  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.98 
 
 		 532 aa  53.5  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3435  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.67 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000801055  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.67 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000955274  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.51 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.16 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  24.15 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.09 
 
 		 576 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.98 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 733 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0794  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  48.98 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  43.4 
 
 		 499 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3975  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.45 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  43.4 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.14 
 
 		 534 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.56 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538528  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  29.45 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.14 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  23.67 
 
 		 392 aa  50.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.16 
 
 		 435 aa  50.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.71 
 
 		 579 aa  50.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0594  cell wall hydrolase/autolysin  46.67 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000169523  decreased coverage  0.000000280884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.44 
 
 		 270 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00646  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase II, murein hydrolase  46.51 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  38.03 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0555  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000230448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.46 
 
 		 840 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000747673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  37.31 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.84 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3713  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000484801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.5 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000116248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  43.48 
 
 		 542 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.22 
 
 		 476 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  38.33 
 
 		 610 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.17 
 
 		 471 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  46.81 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.78 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 523 aa  47  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0493  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.22 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1186  hypothetical protein  26.15 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.44 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  44.68 
 
 		 217 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42.31 
 
 		 679 aa  46.2  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  52.27 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  47.73 
 
 		 342 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  48.84 
 
 		 543 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  39.13 
 
 		 557 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  35.24 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.77 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  45.1 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2480  hypothetical protein  30.39 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  41.27 
 
 		 515 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.9 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.61 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.78 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  42.55 
 
 		 560 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 		 539 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 341 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.67 
 
 		 597 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0520  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36 
 
 		 473 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449196  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 619 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  39.13 
 
 		 515 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 		 749 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.19 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>