15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4627 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4627  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  779    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3459  hypothetical protein  34.8 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1958  hypothetical protein  34.1 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0017  hypothetical protein  29.62 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2478  hypothetical protein  22.22 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.209428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  21.27 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1220  hypothetical protein  23.45 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000662947 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1061  hypothetical protein  21.39 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0638  hypothetical protein  21.12 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0862939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0712  hypothetical protein  21.12 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.599258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1219  hypothetical protein  24.37 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000209891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1686  hypothetical protein  22.65 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000237828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2480  hypothetical protein  23.98 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1185  hypothetical protein  23.03 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  27.96 
 
 		 516 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>