137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2428 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  48.25 
 
 
1103 aa  796    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.76 
 
 
1082 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  48.15 
 
 
1113 aa  785    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.76 
 
 
1082 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.69 
 
 
1084 aa  742    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  45.11 
 
 
1080 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.35 
 
 
1083 aa  722    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  44.95 
 
 
1097 aa  742    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  47.58 
 
 
1158 aa  743    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  46.23 
 
 
1143 aa  759    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  47.25 
 
 
1141 aa  781    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  42.83 
 
 
1151 aa  725    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2428  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1128 aa  2103    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550911  hitchhiker  0.0018506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.13 
 
 
1091 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  32.83 
 
 
1075 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.95 
 
 
1071 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.66 
 
 
1074 aa  406  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.88 
 
 
1061 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.1 
 
 
1127 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.12 
 
 
1068 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.39 
 
 
1077 aa  392  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.22 
 
 
1077 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.95 
 
 
1054 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.12 
 
 
1060 aa  367  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.46 
 
 
1149 aa  365  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.63 
 
 
1064 aa  362  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.17 
 
 
1085 aa  348  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  28.24 
 
 
1123 aa  337  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  28.06 
 
 
1123 aa  332  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  27.97 
 
 
1123 aa  330  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  26.08 
 
 
1164 aa  330  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  28.26 
 
 
1123 aa  326  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  26.6 
 
 
1124 aa  317  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.67 
 
 
1131 aa  313  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  28.45 
 
 
1132 aa  313  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  27.08 
 
 
1148 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  26.7 
 
 
1123 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  26.7 
 
 
1123 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  26.5 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.5 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  26.77 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  26.5 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  26.7 
 
 
1123 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  26.7 
 
 
1123 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  26.5 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  26.5 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  26.5 
 
 
1122 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  26.5 
 
 
1122 aa  308  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.08 
 
 
1098 aa  305  3.0000000000000004e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  24.63 
 
 
1127 aa  305  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  27.11 
 
 
1123 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  26.05 
 
 
1122 aa  303  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  29.17 
 
 
1132 aa  301  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.9 
 
 
1164 aa  299  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  29.01 
 
 
1128 aa  298  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  25.22 
 
 
1163 aa  298  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.97 
 
 
1173 aa  293  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1613  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.31 
 
 
1124 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  31.04 
 
 
1171 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.98 
 
 
1160 aa  282  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.02 
 
 
1158 aa  281  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.07 
 
 
1158 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.51 
 
 
1163 aa  278  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.22 
 
 
1158 aa  277  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.49 
 
 
1160 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  32.23 
 
 
1156 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.39 
 
 
1150 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.4 
 
 
1159 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1749  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.16 
 
 
1121 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246728  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  22.37 
 
 
1144 aa  271  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2839  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  29.79 
 
 
1133 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601793  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.48 
 
 
1166 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.14 
 
 
1157 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.04 
 
 
1184 aa  264  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.29 
 
 
1162 aa  263  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.28 
 
 
1197 aa  261  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1769.1  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.12 
 
 
1114 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0681  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.12 
 
 
1114 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0471  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.12 
 
 
1114 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0516412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1385  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.12 
 
 
1114 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1389  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.69 
 
 
1197 aa  258  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4322  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.03 
 
 
1112 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.98 
 
 
1063 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1188  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.77 
 
 
1354 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.83 
 
 
1206 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.12 
 
 
1198 aa  251  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.65 
 
 
1226 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2852  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.26 
 
 
1149 aa  244  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.481141  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1097  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.62 
 
 
1112 aa  243  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1097  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.47 
 
 
1112 aa  241  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0967574  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4569  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.41 
 
 
1169 aa  241  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0734  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.45 
 
 
1112 aa  240  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1214  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.45 
 
 
1112 aa  240  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1187  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.45 
 
 
1112 aa  238  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.720814  normal  0.579184 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  26.43 
 
 
1260 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.43 
 
 
1260 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.39 
 
 
1192 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.91 
 
 
1270 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.01 
 
 
1270 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51720  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.34 
 
 
1168 aa  233  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>