166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01090 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.77 
 
 
224 aa  231  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  47.2 
 
 
219 aa  218  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  42.4 
 
 
227 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  43.78 
 
 
233 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  45.33 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 
222 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  46.57 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  41.43 
 
 
215 aa  175  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.34 
 
 
222 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.24 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 
226 aa  138  8.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
225 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 
235 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
218 aa  105  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.3 
 
 
229 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.92 
 
 
226 aa  98.2  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.43 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  30.92 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13660  cAMP-binding protein  30.88 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  30.05 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  27.23 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.44 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.95 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  22.38 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.02 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.5 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  23.65 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.36 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  29.26 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.78 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  20.55 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.28 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.31 
 
 
238 aa  52  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.86 
 
 
238 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
231 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.9 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.41 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  23.79 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.01 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  23.29 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.51 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  23.29 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.7 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  27.57 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.43 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  23.47 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.64 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  22.54 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
201 aa  48.5  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.86 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.71 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.96 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.71 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  24.76 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.96 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  22.01 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
230 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.76 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.37 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.14 
 
 
289 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
228 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.92 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.52 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.08 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.82 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.91 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.32 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>