More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2014 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 455 aa  920    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  52.62 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  48.32 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  42.95 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.52 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 476 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  32.29 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  31.73 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 436 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.67 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 422 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.8 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.8 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.7 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  33.17 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 461 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.58 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.92 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.92 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.99 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  36.81 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.12 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.57 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.29 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.59 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.21 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>