235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0205 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  96.67 
 
 		 1172 aa  2050    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1172 aa  2217    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  42.01 
 
 		 1165 aa  805    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  34.6 
 
 		 1108 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  36.85 
 
 		 1180 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  30.7 
 
 		 1116 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  29.69 
 
 		 1114 aa  386  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  23.31 
 
 		 1223 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  37.46 
 
 		 1223 aa  172  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3418  SMC domain protein  36.63 
 
 		 1032 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.43 
 
 		 1029 aa  143  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  25.61 
 
 		 1018 aa  128  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  23.48 
 
 		 1227 aa  125  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 		 1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  30.37 
 
 		 810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  29.26 
 
 		 1039 aa  117  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  36.82 
 
 		 910 aa  115  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  27.17 
 
 		 904 aa  115  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  24.63 
 
 		 1085 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  31.06 
 
 		 1020 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.78 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  33.16 
 
 		 1291 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  32.84 
 
 		 961 aa  112  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  26.7 
 
 		 1265 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 1018 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  31.14 
 
 		 1018 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  25.04 
 
 		 1088 aa  112  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 1018 aa  112  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  32.99 
 
 		 1099 aa  112  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  24.58 
 
 		 1244 aa  112  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  24.45 
 
 		 1230 aa  112  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  33.8 
 
 		 1103 aa  111  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.03 
 
 		 995 aa  111  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.33 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  27.65 
 
 		 1226 aa  110  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  33.51 
 
 		 1020 aa  109  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  25.6 
 
 		 1018 aa  109  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  34.22 
 
 		 1006 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.2 
 
 		 1091 aa  108  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  28.96 
 
 		 1013 aa  108  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  30.99 
 
 		 1017 aa  107  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.68 
 
 		 1018 aa  107  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  29.28 
 
 		 906 aa  106  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.23 
 
 		 1059 aa  105  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  32.11 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  32.11 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  31.72 
 
 		 1227 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  24.39 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  32.11 
 
 		 1018 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  27 
 
 		 1308 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  34.04 
 
 		 1018 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  34.39 
 
 		 851 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  31.65 
 
 		 1029 aa  102  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  30.08 
 
 		 1155 aa  102  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  30.3 
 
 		 1024 aa  102  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  33.33 
 
 		 1020 aa  101  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  31.66 
 
 		 1046 aa  99.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  31.15 
 
 		 1011 aa  99.8  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  32.81 
 
 		 1029 aa  99  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  30.14 
 
 		 1025 aa  99.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  32.8 
 
 		 1029 aa  99  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  34.94 
 
 		 881 aa  99.4  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  32.81 
 
 		 1029 aa  99  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  38.01 
 
 		 1009 aa  98.6  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  32.8 
 
 		 1029 aa  98.6  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.82 
 
 		 1029 aa  98.2  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 1346 aa  97.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  30.58 
 
 		 1022 aa  96.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  25.69 
 
 		 824 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  30.43 
 
 		 1009 aa  96.3  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  28.04 
 
 		 953 aa  96.3  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  32.11 
 
 		 1046 aa  95.9  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  30.91 
 
 		 1226 aa  95.5  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  23.1 
 
 		 1137 aa  95.5  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  28.32 
 
 		 1232 aa  95.5  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  37.72 
 
 		 1234 aa  95.1  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  25.2 
 
 		 1091 aa  94.7  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  29.95 
 
 		 962 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  27.51 
 
 		 1182 aa  93.2  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  28.8 
 
 		 986 aa  92.8  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 		 1144 aa  92  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  33.87 
 
 		 1249 aa  92  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  45.13 
 
 		 1009 aa  91.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  45.13 
 
 		 1009 aa  91.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  28.45 
 
 		 1165 aa  90.5  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.71 
 
 		 1030 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  32.05 
 
 		 1307 aa  90.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  29.51 
 
 		 1081 aa  90.1  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  41.07 
 
 		 815 aa  90.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  30.16 
 
 		 989 aa  90.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  35.47 
 
 		 1219 aa  89.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  28.19 
 
 		 1049 aa  89.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  33.33 
 
 		 1223 aa  89  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  39.74 
 
 		 1247 aa  89  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>