89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2129 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  56.7 
 
 		 1193 aa  934    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  42.65 
 
 		 790 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  42.91 
 
 		 803 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1479 aa  3019    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  47.95 
 
 		 991 aa  705    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  46.9 
 
 		 742 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.36 
 
 		 784 aa  569  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  41.89 
 
 		 768 aa  559  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  39.42 
 
 		 825 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  40.16 
 
 		 825 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  37.92 
 
 		 842 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  40.27 
 
 		 816 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  40.43 
 
 		 759 aa  536  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  38.21 
 
 		 833 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.3 
 
 		 1094 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  39.17 
 
 		 868 aa  526  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  39.3 
 
 		 781 aa  522  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  38.99 
 
 		 802 aa  512  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  38.92 
 
 		 741 aa  509  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  37.96 
 
 		 778 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  38.64 
 
 		 822 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  36.14 
 
 		 864 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  37.62 
 
 		 1164 aa  496  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  37.67 
 
 		 796 aa  494  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  38.85 
 
 		 841 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  39.79 
 
 		 940 aa  493  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1139 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  39.66 
 
 		 786 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  37.62 
 
 		 811 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  35.41 
 
 		 747 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  37.04 
 
 		 758 aa  463  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 		 835 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 		 757 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  34.77 
 
 		 773 aa  425  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  33.46 
 
 		 760 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  33.03 
 
 		 831 aa  365  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  30.22 
 
 		 943 aa  353  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  32.59 
 
 		 824 aa  350  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  29.72 
 
 		 809 aa  340  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  29.11 
 
 		 804 aa  328  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  30.14 
 
 		 856 aa  327  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  32.33 
 
 		 809 aa  320  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 781 aa  309  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  37.2 
 
 		 646 aa  305  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.52 
 
 		 762 aa  292  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  28.95 
 
 		 788 aa  285  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  36.93 
 
 		 837 aa  282  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 808 aa  217  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  30.53 
 
 		 819 aa  207  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.99 
 
 		 809 aa  195  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  50 
 
 		 2142 aa  162  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.1 
 
 		 770 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  37.84 
 
 		 1465 aa  132  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  42.86 
 
 		 1687 aa  131  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  35.68 
 
 		 1455 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.95 
 
 		 1295 aa  127  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  26.28 
 
 		 750 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.13 
 
 		 1206 aa  120  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.95 
 
 		 1236 aa  118  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  25.76 
 
 		 753 aa  118  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  40.69 
 
 		 1069 aa  107  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.22 
 
 		 757 aa  106  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  22.59 
 
 		 928 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  38.26 
 
 		 970 aa  99  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  38.26 
 
 		 693 aa  97.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  37.01 
 
 		 601 aa  95.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  30.05 
 
 		 262 aa  95.1  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  36.6 
 
 		 812 aa  93.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  44.94 
 
 		 116 aa  85.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  32.22 
 
 		 693 aa  84.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  32.82 
 
 		 1193 aa  83.2  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.11 
 
 		 1424 aa  73.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  31.97 
 
 		 1392 aa  73.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  32.62 
 
 		 248 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  27.54 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  34.27 
 
 		 1355 aa  64.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  57.14 
 
 		 1627 aa  62.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1278 aa  60.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  44 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1265 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  32.38 
 
 		 1729 aa  55.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  23.81 
 
 		 2447 aa  54.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  21.14 
 
 		 765 aa  53.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 		 1201 aa  53.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1519  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1513 aa  50.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5029  hypothetical protein  22.25 
 
 		 948 aa  49.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0984885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1748  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.59 
 
 		 1298 aa  45.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723915  normal  0.324613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  25 
 
 		 1323 aa  45.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  32.2 
 
 		 3802 aa  45.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>