More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1366 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  53.44 
 
 		 824 aa  885    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  100 
 
 		 811 aa  1665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 818 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 763 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 759 aa  290  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 735 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 801 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 678 aa  200  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 730 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 776 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  26.53 
 
 		 776 aa  193  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1572  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0693034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08651  hypothetical protein  26.11 
 
 		 799 aa  160  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.950762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 698 aa  135  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 689 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 748 aa  91.3  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 732 aa  89  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  23 
 
 		 707 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 760 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 		 750 aa  88.2  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 699 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 683 aa  84.3  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 821 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 685 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  21.95 
 
 		 685 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 723 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 693 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 866 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.4 
 
 		 859 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 918 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 727 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 828 aa  76.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 836 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 760 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 709 aa  75.5  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  22.35 
 
 		 724 aa  75.1  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 769 aa  75.1  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  22.4 
 
 		 724 aa  74.7  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  22.35 
 
 		 724 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 733 aa  74.3  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 722 aa  74.3  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 783 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 776 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 795 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29.26 
 
 		 848 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  23 
 
 		 724 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 730 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  36.76 
 
 		 652 aa  72  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  27.18 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  22.27 
 
 		 724 aa  71.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  27.18 
 
 		 758 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 702 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 694 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  27.22 
 
 		 758 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  27.18 
 
 		 758 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 882 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 828 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 861 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.98 
 
 		 833 aa  70.1  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 719 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5117  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 751 aa  68.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  23.75 
 
 		 741 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  34.11 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  23.81 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 742 aa  68.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 705 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 747 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 714 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  23.44 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 784 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  26.52 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 719 aa  67  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1147 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 682 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 789 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  36.54 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00089  putative outer membrane receptor protein  43.48 
 
 		 87 aa  65.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 685 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>