More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6143 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  51.41 
 
 		 657 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  51.37 
 
 		 657 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  52.83 
 
 		 663 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  52.99 
 
 		 738 aa  676    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  62.58 
 
 		 660 aa  827    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  51.92 
 
 		 671 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  50.92 
 
 		 666 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  52.42 
 
 		 663 aa  662    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  53.29 
 
 		 666 aa  658    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  61.04 
 
 		 692 aa  797    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  54.52 
 
 		 660 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  51.14 
 
 		 671 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  50.76 
 
 		 671 aa  652    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  62.46 
 
 		 659 aa  795    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  51.56 
 
 		 686 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  51.09 
 
 		 684 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  100 
 
 		 682 aa  1387    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.53 
 
 		 673 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  50.31 
 
 		 671 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  51.61 
 
 		 658 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  52.61 
 
 		 667 aa  631  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  51.99 
 
 		 695 aa  631  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  51.54 
 
 		 655 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  50.76 
 
 		 671 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  49.69 
 
 		 653 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  51.3 
 
 		 681 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  51.3 
 
 		 681 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  45.72 
 
 		 690 aa  617  1e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  51.45 
 
 		 651 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  47.3 
 
 		 663 aa  616  1e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  51.88 
 
 		 657 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  51.15 
 
 		 681 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  49.39 
 
 		 661 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  50.61 
 
 		 663 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  49 
 
 		 655 aa  608  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  50.39 
 
 		 660 aa  611  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  50.08 
 
 		 672 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  50.31 
 
 		 670 aa  606  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  49.92 
 
 		 672 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  51.55 
 
 		 668 aa  606  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  48.93 
 
 		 686 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  47.1 
 
 		 665 aa  602  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  45.94 
 
 		 661 aa  600  1e-170  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  48.09 
 
 		 661 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  49.77 
 
 		 672 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  49.09 
 
 		 673 aa  600  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  48.91 
 
 		 677 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  51.68 
 
 		 657 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  51.07 
 
 		 657 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  49.07 
 
 		 672 aa  591  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  48.53 
 
 		 662 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  50.91 
 
 		 657 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  47.19 
 
 		 678 aa  591  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  49.69 
 
 		 662 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  48.43 
 
 		 663 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  47.01 
 
 		 661 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  47.73 
 
 		 694 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.2 
 
 		 680 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  47.16 
 
 		 671 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  46.05 
 
 		 663 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  49.01 
 
 		 666 aa  566  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  49.16 
 
 		 665 aa  568  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.46 
 
 		 664 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  45.66 
 
 		 671 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  47.72 
 
 		 653 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  48.94 
 
 		 663 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  47.57 
 
 		 660 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  46.74 
 
 		 665 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  47.16 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  47.16 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  46.44 
 
 		 666 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  45.51 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  47.58 
 
 		 690 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  45.56 
 
 		 723 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  47.58 
 
 		 690 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  47.58 
 
 		 690 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  48.25 
 
 		 665 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  47.58 
 
 		 690 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  47.58 
 
 		 690 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  47.22 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  47.58 
 
 		 696 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  45.68 
 
 		 657 aa  561  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  47.01 
 
 		 663 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  46.91 
 
 		 675 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  48.31 
 
 		 680 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  47.58 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  47.16 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  47.16 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  47.01 
 
 		 663 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  47.16 
 
 		 663 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  46.86 
 
 		 663 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  47.37 
 
 		 664 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  47.6 
 
 		 664 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  46.91 
 
 		 662 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  47.52 
 
 		 663 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  46.76 
 
 		 666 aa  555  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  46.89 
 
 		 664 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  47.45 
 
 		 664 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02341  transketolase  46.58 
 
 		 666 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.904862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  46.62 
 
 		 664 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>