More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5664 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  100 
 
 		 490 aa  983    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  65.85 
 
 		 508 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  57.37 
 
 		 495 aa  524  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  55.96 
 
 		 495 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  46.46 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  44.31 
 
 		 495 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  31.9 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  31.9 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  33.52 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  31.62 
 
 		 704 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  31.62 
 
 		 704 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  34.09 
 
 		 563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  32.28 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 559 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  33.24 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  31.3 
 
 		 559 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.82 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  32.57 
 
 		 565 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  33.06 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  31.97 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  33.72 
 
 		 417 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  32.96 
 
 		 559 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  28.94 
 
 		 716 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  31.13 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  31.45 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  31.45 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  31.45 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  31.45 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  30.33 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  30.49 
 
 		 624 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  31.92 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  29.16 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  31.31 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  31.44 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  31.03 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  30.77 
 
 		 575 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  32.77 
 
 		 559 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  32.77 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  31.03 
 
 		 578 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  30.53 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 578 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.53 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  31.03 
 
 		 578 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.13 
 
 		 394 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  30.5 
 
 		 578 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.28 
 
 		 304 aa  96.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  31.34 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1772  phage integrase-like protein SAM-like protein  60.87 
 
 		 93 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62021  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  29.92 
 
 		 421 aa  93.6  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  29.6 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  31.71 
 
 		 630 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  29.8 
 
 		 770 aa  91.3  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 299 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.28 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.36 
 
 		 299 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.44 
 
 		 299 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  29.27 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  28.25 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.65 
 
 		 311 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.38 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  29.4 
 
 		 732 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.44 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  31.45 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.66 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.44 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.83 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.09 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  32.22 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  28.81 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.04 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  25.59 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  31.29 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  27.51 
 
 		 734 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  26.71 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.81 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  29.64 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  23.79 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.82 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  31.27 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.92 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.75 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  30.66 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  27.63 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  26.84 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>